قد تتسبب أدوية الاكتئاب باحداث خطر وضرر على الجنين وذلك بسبب اختراقها للمشيمة ووصولها للطفل، حيث أنها من الممكن أن تتسبب في حدوث مشاكل واضطرابات خلقية لدى الجنين، الا ان إصابة الام بالاكتئاب قد يشكل خطرا على حياة الجنين وعلى حياتها، لهذا السبب فإن من يمكنه أن يحدد مقدار الضرر والفائدة من أخذ مضادات الاكتئاب أثناء فترة الحمل هو الطبيب المعالج والمختص فقط، حيث أن بعض حالات الاكتئاب الشديدة قد تحتاج إلى استمرار العلاج حتى أثناء الحمل، وفي تلك الحالات يتم استخدام الأدوية التي تنتمي لمثبطات مستقبلات السيروتونين الانتقائية Selective Serotonnin Receptor Inhibitors حيث أن الأضرار التي قد تحدثها أقل نسبة من باقي أنواع مضادات الاكتئاب