يتم إجراء تحليل الحمض النووي للجنين cfDNA عبر أخذ عينة من دم الحامل، وبإمكانها إجراء هذا التحليل منذ الأسبوع العاشر من الحمل وحتى موعد الولادة. ويعد من الفحوصات المفضلة للكشف عن عدة اختلالات جينية، مثل متلامة داون، ومتلازمتي التثلث الصبغي ١٣ و ١٨، إذ يمتاز بسهولة إجرائه وتسببه بمضاعفات أقل مقارنة بأساليب الكشف الأخرى. ولكن بعض الدراسات الحديثة أفادت بانخفاض دقة هذا التحليل وفشله في الكشف عن الاختلالات الجينية الأخرى غير تلك المذكورة سابقاً.