يمكن تقسيم البيئات المهمة للطيور في منطقة الحدود الشمالية إلى: بيئة المناطق الجبلية، وبيئة مناطق الأودية، وبيئة المناطق الرملية الحصوية والحجرية، أما بالنسبة إلى البيئة الجبلية فيستوطنها عدد من الطيور التي لها أهمية عالمية وأخرى إقليمية، ويقصد بالأنواع التي لها أهمية عالمية، تلك الأنواع المنتشرة في مناطق متعددة من العالم، ولكن أعدادها تناقصت بنسبة تزيد على 20% خلال السنوات الخمس الماضية، وأصبحت مهددة بالانقراض. أما الأنواع التي لها أهمية إقليمية فيقصد بها الأنواع ذات التوزيع الإقليمي أو المحلي، ومن هذه الطيور النسر الأسود والعويسق، وهما من الطيور المهددة بالانقراض على مستوى العالم، وذلك حسب التصنيف للمجلس العالمي لحياة الطيور  ،  ومن الطيور ذات الأهمية الإقليمية: الحجل الرملي، والرخمة المصرية، والأبلق الأسود أبيض القنة، والقليعي أسود الذيل، والبومة الصغيرة، والعوسق   الذي يعرف محليًا بـ (الحميميق). ومن المناطق المهمة للطيور في هذه البيئات الجزء الشمالي الشرقي من محمية حرة الحرة الذي يمتاز بعدد من الجبال البازلتية غرب حزم الجلاميد، مثل: جبل العامود، وجبل الشيحية، وجبل اللويزية، وهذه المنطقة مهمة لتعشيش بعض الطيور، مثل: الحجل الرملي، والأبلق الأسود أبيض القنة، والبومة الصغيرة، والبومة العقابية.

 

أما بيئة الأودية فهي تمتاز بزيادة الغطاء النباتي، كما أن بها عددًا من المساحات المزروعة، وبكثافة الأشجار في أجزاء منها، وتوجد هذه البيئات في وادي عرعر ووادي التربة، وأودية أخرى، مثل: الرشيدية، ومعارك، وفيحان، ومن أهم الطيور في هذه البيئات: القمري  ، والعوسق، وهازجة الشجر، ويصلها عدد من الطيور المهاجرة، مثل: طيور الحبارى التي سجلت بالقرب من وادي معارك في محمية حرة الحرة، وكذلك الصفاري وعدد من طيور الدخل، مثل: أبو طاقية. أما منطقة البيئات الرملية الحصوية فهي مناطق سهلية مفتوحة، ومن أهم الطيور المسجلة فيها طيور القبرات التي تعد من أهم المناطق لهذه الطيور، وقد سجل فيها أكثر من أحد عشر نوعًا، منها: القبرة المتوجة، والقبرة الهدهدية، والقبرة موشمة الذيل، وهناك قبرات مهاجرة تقضي الشتاء في المنطقة، مثل: القبرة الشرقية، كذلك هناك مجموعات أخرى مهاجرة سجلت في هذه البيئات، مثل: الدراج العسلي، والكروان، والحبارى، والعقاب الإمبراطوري.